生物信息学一些基本的常用软件有哪些？

• 序列拼接工具：Velvet、SOAPdenovo、SSAKE、ABySS、Trinity。
• 微卫星片段比对工具：bwa、bowtie、tophat、SOAPaligner。
• 多序列比对工具：BLAST、BLAT、CrossMatch。
• 基因预测工具：Glimmer、GeneMark、Augustus、Gensh、SNAP、GeneScan、EuGene、Glean。
• 重复序列识别工具：RepeatMasker、TRF。
• 聚类分析工具：MCL、hcluster_sg。
• 统计分析工具：PLINK、TASSEL、R、SPSS。

这些软件在生物信息学研究中发挥着重要作用。