故事开始于主角在家中观看电视，得知红色暴鲤龙的新闻，随即，母亲指示你出门寻找男二，你离开家门，朝左上方向前进，很快便找到男二家，男二匆匆出门，留下一句自信满满的台词后又返回家中，你进入男二家二楼，他再次看到你后又一次离开。
离开男二家后，向北前行，你会遇见男二正在村口等待，与男二同行，你们向西走到神事湖畔，这是新奥地区的三大湖泊之一，你和男二发现博士和小光正在草丛中交谈，待他们离开后，你们发现他们留下了一个装有口袋妖怪（PM）的箱子，正当你们调查箱子时，野生PM突然袭来，你需要迅速选择一只PM进行战斗（可选的PM包括炎系的小火焰猴、水系波加曼和草系的草苗龟）。
博士赶到现场后，看到你使用的PM，并未将其收回球中，而是带着箱子迅速离去，在回村的路上，你遇到了博士和小光，与他们交流后，博士离开。
回到家后，母亲为你准备了跑鞋，你离开村子，向右前行，途中会在商店得到一瓶恢复20HP的伤药，小光会引导你再次找到博士，正式获得初始的御三家口袋妖怪并接受相关任务，你还需要回家与母亲和男二的母亲交谈，获取更多的任务信息，小光会教你如何捕捉口袋妖怪。
整个攻略过程中充满了冒险与未知，你需要与伙伴一起探索这个充满神秘的世界，收集口袋妖怪，完成各种任务，期待你的精彩表现！
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