高速交警支队是全国高速公路交通管理部门的派出机构，主要负责处理高速公路交通事故、管理车辆上路行驶等问题。而交警支队则是在各级公安机关中设立的交通管理机构，主要负责处理城S道路交通中的各类违法行为。虽然两者都属于警察系统，但职责范围和管理方式有所区别。
工作区域不同高速交警支队主要负责高速公路所管辖区域内车辆违法、交通事故的处理，而交警支队主要负责S区、国道、S道及SX乡村道路的交通违法、交通事故的处理。
有所不同高速交警支队的工作主要围绕着高速公路内的交通违法进行处理，例如对超速行驶、疲劳驾驶等行为进行查处；而交警支队则涵盖了城S道路交通中的所有违法行为，包括但不限于交通违章、酒驾等。
高速交警支队和交警支队的主要区别在于工作的区域和任务的不同。
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