广州水上巴士航线共有13条航线、35座码头，客运船舶46艘，总里程53.46公里，是广州S继公共汽车、出租车、地铁后的第4套公交系统，为缓解陆上交通压力、服务S民出行发挥了重要的作用。
广州水上巴士S2航线：芳村-西堤-天字-中大-广州塔-海心沙
营运时间： 芳村：上午7:时（停靠海心沙），8:时（停靠海心沙），下午17:时（停靠海心沙），18:时（停靠海心沙） 广州塔：上午7:时、8:时 海心沙：下午17:时、18:时
注：1. 因海心沙公园9点开门，故9:时前航班调整为广州塔码头发班。 2. 工作日开航,节假日不开设公交航班。
班次间隔： 芳村：每隔6分钟一班次 广州塔：每隔6分钟一班次 海心沙：每隔6分钟一班次
公交接驳情况： 芳村码头公交： 芳村码头总站：782、966 公交线路主要覆盖：码头周边居民和商铺
地铁： 1号线芳村站 西堤码头公交： 南方大厦总站：1、38、238、251、538、高峰快线36、31、57、64、128、131a、186、28、29、217、219、236、281、552、556、823、旅游2线、夜31、夜26、夜69、夜72 公交线路主要覆盖：码头周边商户，人民南、上下九等商圈
地铁： 六号线文化公园站 天字码头公交： 南关站：1、1、183、194、219、544、夜1 天字站码头站：4、57、128、131、28、夜31 公交线路主要覆盖：码头周边商户，北京路商圈
地铁： 二号线海珠广场站、六号线北京路站 中大码头公交： 中大北门站8、11、24、121、121A、131A、131B、182、229、247、266、旅游1线、旅游2线、夜6、夜42 公交线路主要覆盖：码头周边住户、新港路、下渡路
广州塔码头公交： 广州塔码头站：262、468 公交线路主要覆盖：客村、赤岗等区域居民和商铺
地铁：三号线（广州塔站）、APM线枢纽站 海心沙码头公交： 海心沙站：499、866 海心沙公园：293、499
地铁：APM线海心沙站