- 随园校区：主要为研究生博士生及留学生服务，随园校区自XX创立以来，历经百余年的历史，现已形成一定的建设规模和建筑布局,始建于上世纪二十年代的文物保护建筑群。
- 紫金校区：主要是自考学生以及南师大电自院、动科学院；紫金校区的前身是南京动力高等专科XX，2000年整体并入南京师范DX后,在原校址的基础上设立了紫金校区。
- 仙林校区：作为最大的校区，本一学生的大部分（除了电自院、动院的学生）都集中在此，仙林校区于1998年4月开工,至2010年基本完成整个校区的建设。
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